可以先区分必须提交的鉴别材料与确需保密的代码。按《计算机软件著作权登记办法》，通常提交源程序和一种文档的前、后各连续30页；符合条件时，可选择例外交存，例如对所交源程序中的机密部分作遮盖，但遮盖部分不得超过交存源程序的50%，也可采用规定的其他例外交存方式。申请人还可申请对源程序、文档或样品封存。准备材料时应保留连续性与真实性，确保软件名称、权利人和文档一致，并先核对登记机构当前的提交要求，避免因过度遮盖影响受理。